Voce esta provavelmente esta usando o comando include do PHP, que inclui um subscript dentro de um script, se voce nao indicou um diretorio, ele procurara em /php/includes ou em /usr/share/php.
Para resolver esse problema devera colocar os arquivos a serem incluidos ao outros em um desses diretorios, ou entao modificar o arquivo php.ini na linha do include_path, ou entao dentro dos arquivos php indicar o diretorios onde se encontram os arquivos de inclusao.
