Marcos, entendi a sua explicação, mas não sei exatamente aonde está havendo saída de dados. Já procurei mas não achei. Meu connect completo está assim:

<?php
$nome_site = "Intranet - Gopinatha Services"; //Nome do site
$email = "webmaster@gopinatha.com.br"; //E-mail do administrador
$site = "http://www.gopinatha.com.br/intr/"; //Seu site n se esuqece de bota o http://


// Configurações do Script
// ==============================
$_SG['conectaServidor'] = true; // Abre uma conexão com o servidor MySQL?
$_SG['abreSessao'] = true; // Inicia a sessão com um session_start()?


$_SG['caseSensitive'] = false; // Usar case-sensitive? Onde 'thiago' é diferente de 'THIAGO'


$_SG['validaSempre'] = true; // Deseja validar o usuário e a senha a cada carregamento de página?
// Evita que, ao mudar os dados do usuário no banco de dado o mesmo contiue logado.


$_SG['servidor'] = 'localhost'; // Servidor MySQL
$_SG['usuario'] = 'root'; // Usuário MySQL
$_SG['senha'] = 'pimpao'; // Senha MySQL
$_SG['banco'] = 'intranet'; // Banco de dados MySQL


$_SG['paginaLogin'] = 'http://www.gopinatha.com.br/intr/index.html&#039;; // Página de login


$_SG['tabela'] = 'usu'; // Nome da tabela onde os usuários são salvos
// ==============================


// ======================================
// ~ Não edite a partir deste ponto ~
// ======================================


// Verifica se precisa fazer a conexão com o MySQL
if ($_SG['conectaServidor'] == true) {
$_SG['link'] = mysql_connect($_SG['servidor'], $_SG['usuario'], $_SG['senha']) or die("MySQL: Não foi possível conectar-se ao servidor [".$_SG['servidor']."].");
mysql_select_db($_SG['banco'], $_SG['link']) or die("MySQL: Não foi possível conectar-se ao banco de dados [".$_SG['banco']."].");
}


// Verifica se precisa iniciar a sessão
if ($_SG['abreSessao'] == true) {

if(session_id()=="") session_start();
}


/**
* Função que valida um usuário e senha
*
* @param string $usuario - O usuário a ser validado
* @param string $senha - A senha a ser validada
*
* @return bool - Se o usuário foi validado ou não (true/false)
*/
function validaUsuario($usuario, $senha) {
global $_SG;


$cS = ($_SG['caseSensitive']) ? 'BINARY' : '';


// Usa a função addslashes para escapar as aspas
$nusuario = addslashes($usuario);
$nsenha = addslashes($senha);


// Monta uma consulta SQL (query) para procurar um usuário
$sql = "SELECT `usu`.`usuario`, `usu`.`nome`, `usu`.`senha`, `usu`.`nivel`, `funcs`.`funcao` FROM `funcs` INNER JOIN `usu` ON `funcs`.`id_funcao` = `usu`.`fnc` WHERE ".$cS." `usuario` = '".$nusuario."' AND ".$cS." `senha` = '".$nsenha."' LIMIT 1";
$query = mysql_query($sql);
$resultado = mysql_fetch_array($query);


// Verifica se encontrou algum registro
if (empty($resultado)) {
// Nenhum registro foi encontrado => o usuário é inválido
return false;


} else {
// O registro foi encontrado => o usuário é valido


// Definimos dois valores na sessão com os dados do usuário
$_SESSION['usuario'] = $resultado['usuario']; // Pega o valor da coluna 'id do registro encontrado no MySQL
$_SESSION['cpf'] = $resultado['cpf']; // Pega o valor da coluna 'nome' do registro encontrado no MySQL


// Verifica a opção se sempre validar o login
if ($_SG['validaSempre'] == true) {
}


return true;
}
}


/**
* Função que protege uma página
*/
function protegePagina() {
global $_SG;


if (!isset($_SESSION['usuario']) OR !isset($_SESSION['cpf'])) {
// Não há usuário logado, manda pra página de login
expulsaVisitante();
} else if (!isset($_SESSION['usuario']) OR !isset($_SESSION['cpf'])) {
// Há usuário logado, verifica se precisa validar o login novamente
if ($_SG['validaSempre'] == true) {
// Verifica se os dados salvos na sessão batem com os dados do banco de dados
if (!validaUsuario($_SESSION['usuario'], $_SESSION['cpf'])) {
// Os dados não batem, manda pra tela de login
expulsaVisitante();
}
}
}
}


/**
* Função para expulsar um visitante
*/
function expulsaVisitante() {
global $_SG;


// Remove as variáveis da sessão (caso elas existam)
unset($_SESSION['usuarioNome'], $_SESSION['usuarioLogin'], $_SESSION['usuarioSenha']);


// Manda pra tela de login
header("Location: ".$_SG['paginaLogin']);
}

Marcos, descobri... O connect.php estava no include e não na pgina que o chama.
Obrigado pela dica!