Devido a novas restrições de segurança do Internet Explorer, o script não conseguia ser executado de forma adequada. Aliás, nenhuma outra instrução javascript é executada quando ele resolve barrar os script por isso alterei a forma de verificação. Agora ele executa scripts se o nível de segurança estiver baixo e a mensagem padrão de que existe um antipopup é substituida por outra.