o Problema é que provavelmente o usuário do PHP não terá permissões de ler nada que não seja dele.
É como um usuário de baixo nivel de permissão tentar listar subdiretórios de um usuário como o root.
Isso teria que ser feito talvez usando algo como suexec ou ainda fazer o php executar um 'ls -al / ' como se fosse o usuário alvo.
Complicado isso que quer.