Estou totalmente perdida em php-gtk , quem pode me ajudar? Fiz uma janela principal com um menu e o sub-menu, como faço para conectar um arquivo.php em um sub-menu?

Na verdade o que você deve conectar é o sub-menu à chamada de algum método ou função que está contido no arquivo.php

Dá uma olhada em http://gtk.php.net/docs.php

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